MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD3

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013719	TAG	2	6	9	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013719	TC	3	6	17	22	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013719	TCG	2	6	25	30	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013719	GGA	2	6	171	176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283454956
5	NC_013719	CAT	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454956
6	NC_013719	GAA	2	6	216	221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454956
7	NC_013719	A	6	6	264	269	100 %	0 %	0 %	0 %	283454956
8	NC_013719	AAC	2	6	323	328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454956
9	NC_013719	TTG	2	6	338	343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283454956
10	NC_013719	ATG	2	6	467	472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454956
11	NC_013719	GCA	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454956
12	NC_013719	T	6	6	496	501	0 %	100 %	0 %	0 %	283454956
13	NC_013719	A	7	7	540	546	100 %	0 %	0 %	0 %	283454956
14	NC_013719	GCC	2	6	580	585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454956
15	NC_013719	TTG	2	6	587	592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283454956
16	NC_013719	CG	3	6	653	658	0 %	0 %	50 %	50 %	283454956
17	NC_013719	ATC	2	6	662	667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454956
18	NC_013719	GCC	2	6	727	732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454956
19	NC_013719	TTG	2	6	752	757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283454956
20	NC_013719	GGA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283454956
21	NC_013719	CAG	2	6	823	828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454956
22	NC_013719	AGCAAA	2	12	836	847	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	283454956
23	NC_013719	A	6	6	845	850	100 %	0 %	0 %	0 %	283454956
24	NC_013719	GTTC	2	8	868	875	0 %	50 %	25 %	25 %	283454956
25	NC_013719	GCT	2	6	993	998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454956
26	NC_013719	AAC	2	6	1127	1132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454956
27	NC_013719	G	6	6	1166	1171	0 %	0 %	100 %	0 %	283454956
28	NC_013719	CCG	2	6	1226	1231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454956
29	NC_013719	GCT	2	6	1297	1302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454956
30	NC_013719	GAA	2	6	1414	1419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454956
31	NC_013719	CAG	2	6	1528	1533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454956
32	NC_013719	GAA	2	6	1540	1545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454956
33	NC_013719	AG	3	6	1576	1581	50 %	0 %	50 %	0 %	283454956
34	NC_013719	GTA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454956
35	NC_013719	A	6	6	1680	1685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013719	TGA	2	6	1710	1715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013719	CCT	2	6	1796	1801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013719	TTC	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013719	T	6	6	1859	1864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013719	G	6	6	1894	1899	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013719	TGT	2	6	1956	1961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013719	AAAC	2	8	1985	1992	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013719	TC	3	6	2009	2014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013719	GGTC	2	8	2046	2053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013719	GAA	2	6	2103	2108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454957
46	NC_013719	GAT	2	6	2136	2141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454957
47	NC_013719	CTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454957
48	NC_013719	CAG	2	6	2199	2204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454957
49	NC_013719	CTGG	2	8	2225	2232	0 %	25 %	50 %	25 %	283454957
50	NC_013719	TG	3	6	2422	2427	0 %	50 %	50 %	0 %	283454957
51	NC_013719	CGT	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454957
52	NC_013719	GCA	2	6	2853	2858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454957
53	NC_013719	A	7	7	2913	2919	100 %	0 %	0 %	0 %	283454957
54	NC_013719	ACG	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454957
55	NC_013719	CGT	2	6	2955	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454957
56	NC_013719	AGC	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454957
57	NC_013719	TGGA	2	8	3045	3052	25 %	25 %	50 %	0 %	283454957
58	NC_013719	AAT	2	6	3083	3088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283454957
59	NC_013719	GTTA	2	8	3094	3101	25 %	50 %	25 %	0 %	283454957
60	NC_013719	CAA	2	6	3111	3116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013719	C	6	6	3119	3124	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_013719	T	6	6	3126	3131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013719	TGGT	2	8	3137	3144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013719	AGC	2	6	3204	3209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013719	CGG	2	6	3218	3223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013719	GGT	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013719	CGC	2	6	3282	3287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013719	AGCG	2	8	3306	3313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013719	GCA	2	6	3468	3473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454958
70	NC_013719	CCA	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454958
71	NC_013719	TGC	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454958
72	NC_013719	GCT	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454958
73	NC_013719	T	6	6	3646	3651	0 %	100 %	0 %	0 %	283454958
74	NC_013719	T	6	6	3676	3681	0 %	100 %	0 %	0 %	283454958
75	NC_013719	CGT	2	6	3686	3691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454958
76	NC_013719	T	8	8	3699	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	283454958
77	NC_013719	CTG	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454958
78	NC_013719	GTT	2	6	3837	3842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283454958
79	NC_013719	ATA	2	6	3850	3855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283454958
80	NC_013719	CTGC	2	8	3865	3872	0 %	25 %	25 %	50 %	283454958
81	NC_013719	ATC	2	6	3888	3893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454958

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.